DNA-6mA甲基化测序
随着测序技术的快速发展，科研者们在真核生物中（果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等）发现了DNA-6mA的存在，并且发现了DNA-6mA甲基化能影响基因表达.
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大片段测序（BAC)
BAC克隆等大片段DNA测序已在国内外全基因组测序和功能基因筛选中得到广泛应用，但因为涉及高质量的shotgun文库构建和大规模、高通量测序平台的建立，目前国内除参加过人类基因组计划的研究机构外，还鲜
DNA甲基化检测--重亚硫酸盐的测序法（Bisulfite Genomic Sequence，BSP）
重亚硫酸盐的测序法是一种灵敏的能直接检测分析基因组DNA甲基化模式的方法。重亚硫酸盐处理后，用针对改变后的DNA序列设计特异性引物并进行聚合酶链式反应（PCR）。
全转录组测序
真核生物转录组测序的研究对象为特定组织或细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括 mRNA、LncRNA和环状RNA 。